More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5756 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 347 aa  699    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  53.76 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  49.27 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0918  transcriptional regulator, LacI family  42.94 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  39.76 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.28 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.45 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.99 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  35.86 
 
 		 346 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  31.73 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  33.02 
 
 		 343 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.21 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  35.36 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.7 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  37.54 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.53 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.65 
 
 		 335 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  35.53 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.86 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.36 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.59 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.99 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1039  transcriptional regulator, LacI family  35.07 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3360  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  30.72 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.23 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  34.68 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.49 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0141  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 		 386 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.65 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.19 
 
 		 332 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.32 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.29 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.49 
 
 		 356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.52 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3688  LacI family transcription regulator  35.56 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.95 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  36.62 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.08 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  30.09 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.59 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.59 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.59 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  29.97 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.59 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.99 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1669  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.59 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  30.99 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.11 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  32.57 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.87 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 353 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 343 aa  150  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.81 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  31.86 
 
 		 334 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.99 
 
 		 339 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 335 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06650  transcriptional regulator, LacI family  33.89 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  30.57 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  29.62 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  35.9 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  26.59 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.52 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0853  transcriptional regulator, LacI family  34.54 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  29.45 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  27.73 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2985  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.54 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02685  DNA-binding transcriptional repressor  34.21 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0878  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.21 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>