More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0512 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  100 
 
 
336 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  89.52 
 
 
335 aa  597  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  41.79 
 
 
353 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  38.91 
 
 
335 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.08 
 
 
330 aa  225  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  38.91 
 
 
348 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  42.51 
 
 
333 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 
341 aa  222  7e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  40.24 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.67 
 
 
336 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  40.47 
 
 
368 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  41.67 
 
 
330 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  41 
 
 
348 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  41.27 
 
 
341 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  40.46 
 
 
338 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  37.03 
 
 
332 aa  205  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  39.04 
 
 
340 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.85 
 
 
339 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 
338 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 
340 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  38.53 
 
 
351 aa  202  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 
337 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 
337 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.18 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  40.95 
 
 
331 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 
342 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 
335 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  32.29 
 
 
353 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  40.7 
 
 
342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.23 
 
 
331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.98 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  39.02 
 
 
336 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 
333 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  38.64 
 
 
355 aa  198  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 
342 aa  198  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  39.41 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.94 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  34.95 
 
 
332 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 
346 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 
346 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  40.18 
 
 
361 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  36.58 
 
 
342 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 
361 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  39.35 
 
 
340 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  37.17 
 
 
336 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  38.58 
 
 
340 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.27 
 
 
337 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
351 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.84 
 
 
337 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 
334 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  36.69 
 
 
355 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  38.37 
 
 
343 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  38.51 
 
 
343 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  38.37 
 
 
343 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  38.37 
 
 
343 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.65 
 
 
335 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  35 
 
 
340 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  35.88 
 
 
343 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 
343 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 
344 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
341 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  38.96 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.14 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  36.18 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.72 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  34.91 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  34.14 
 
 
333 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  37.16 
 
 
337 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  34.22 
 
 
348 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  36.01 
 
 
343 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1442  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 
341 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 
336 aa  189  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 
339 aa  189  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  36.56 
 
 
357 aa  189  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  35.5 
 
 
340 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.93 
 
 
338 aa  188  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 
340 aa  188  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  34.48 
 
 
334 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.8 
 
 
342 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.33 
 
 
332 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.8 
 
 
342 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 
338 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 
343 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 
353 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 
337 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  32.93 
 
 
333 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 
336 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  37.79 
 
 
355 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 
333 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 
328 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 
343 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  34.23 
 
 
334 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  34.85 
 
 
332 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 
336 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  36.95 
 
 
348 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 
343 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 
388 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 
358 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>