More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2985 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02685  DNA-binding transcriptional repressor  99.71 
 
 
343 aa  707    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0853  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
343 aa  707    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02646  hypothetical protein  99.71 
 
 
343 aa  707    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2985  DNA-binding transcriptional regulator GalR  100 
 
 
343 aa  707    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  99.71 
 
 
343 aa  707    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2984  DNA-binding transcriptional regulator GalR  99.71 
 
 
343 aa  707    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0878  DNA-binding transcriptional regulator GalR  99.71 
 
 
343 aa  707    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4106  DNA-binding transcriptional regulator GalR  99.71 
 
 
343 aa  706    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  hitchhiker  0.000026097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3157  DNA-binding transcriptional regulator GalR  99.71 
 
 
343 aa  707    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674454  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3178  DNA-binding transcriptional regulator GalR  90.96 
 
 
342 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3226  DNA-binding transcriptional regulator GalR  90.96 
 
 
342 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3241  DNA-binding transcriptional regulator GalR  90.96 
 
 
342 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000512141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3160  DNA-binding transcriptional regulator GalR  90.96 
 
 
342 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706978  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3342  DNA-binding transcriptional regulator GalR  90.67 
 
 
342 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0205886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3278  DNA-binding transcriptional regulator GalR  87.99 
 
 
338 aa  598  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  80.72 
 
 
340 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  80.72 
 
 
340 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  80.72 
 
 
340 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3832  DNA-binding transcriptional regulator GalR  80.06 
 
 
339 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  73.27 
 
 
336 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  72.07 
 
 
336 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  77.58 
 
 
348 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  75.83 
 
 
337 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  58.61 
 
 
332 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1562  DNA-binding transcriptional regulator GalS  57.61 
 
 
345 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  56.85 
 
 
340 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  57.27 
 
 
335 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  57.27 
 
 
346 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2430  DNA-binding transcriptional regulator GalS  56.67 
 
 
340 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.688486  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2426  DNA-binding transcriptional regulator GalS  56.97 
 
 
340 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.656004  normal  0.991172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2540  DNA-binding transcriptional regulator GalS  56.97 
 
 
340 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  0.113132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  55.89 
 
 
346 aa  364  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  55.89 
 
 
346 aa  364  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2337  DNA-binding transcriptional regulator GalS  56.67 
 
 
340 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  55.89 
 
 
346 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  55.89 
 
 
346 aa  364  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2382  DNA-binding transcriptional regulator GalS  56.67 
 
 
340 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.824252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  55.89 
 
 
346 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  55.89 
 
 
346 aa  364  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  55.89 
 
 
346 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03325  transcriptional regulator  56.53 
 
 
332 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  55.93 
 
 
332 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2446  DNA-binding transcriptional regulator GalS  55.59 
 
 
346 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  45.4 
 
 
342 aa  305  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00229  putative GalR repressor of contiguous operon, likely to bind a galactoside  44.24 
 
 
351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1608  HTH-type transcriptional regulator GalR  44.68 
 
 
340 aa  279  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.656083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  42.6 
 
 
334 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  44.11 
 
 
338 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  44.11 
 
 
338 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  42.42 
 
 
335 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1669  HTH-type transcriptional regulator GalR  42.12 
 
 
335 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  42.42 
 
 
335 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  42.12 
 
 
335 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  42.12 
 
 
335 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2681  LacI family transcription regulator  40.84 
 
 
335 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.79 
 
 
332 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  38.48 
 
 
332 aa  250  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2679  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 
337 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3616  LacI family transcription regulator  40.61 
 
 
345 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0552  transcriptional regulator for galactose, periplasmic binding protein, LacI family protein  36.06 
 
 
334 aa  242  7e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  37.39 
 
 
333 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  39.7 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  40.18 
 
 
334 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  40.18 
 
 
334 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  39.58 
 
 
333 aa  235  9e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  39.02 
 
 
334 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  39.02 
 
 
334 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  39.02 
 
 
334 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.72 
 
 
334 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  37.5 
 
 
333 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.2 
 
 
342 aa  227  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  36.59 
 
 
352 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  37.88 
 
 
340 aa  222  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 
344 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.29 
 
 
342 aa  209  8e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 
338 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.65 
 
 
336 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  35.62 
 
 
337 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  35.62 
 
 
337 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 
336 aa  202  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  35.15 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  32.52 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 
337 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.62 
 
 
347 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 
332 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  34.62 
 
 
332 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0975  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 
337 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0998  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 
337 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 
327 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  35.44 
 
 
333 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.04 
 
 
328 aa  188  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 
328 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  34.53 
 
 
340 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  34.53 
 
 
339 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.04 
 
 
328 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>