More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5463 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 344 aa  663    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  56.25 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  55.95 
 
 		 348 aa  331  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  53.43 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  54.6 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  54.65 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  52.82 
 
 		 340 aa  322  6e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  54.35 
 
 		 335 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  53.71 
 
 		 473 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  53.51 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  55.79 
 
 		 335 aa  318  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  54.3 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  56.72 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  51.17 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  51.03 
 
 		 344 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  50.45 
 
 		 361 aa  292  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  50.75 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  55.19 
 
 		 345 aa  288  7e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  49.85 
 
 		 339 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  48.25 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  49.26 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  51.63 
 
 		 338 aa  270  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  47.29 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  50.16 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  48.98 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  49.25 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  46.47 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  47.02 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  45.91 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  47.67 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  45.37 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  50.3 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  41.62 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  45.35 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  53.02 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  46.65 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  39.77 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  36.45 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  38.99 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  37.05 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  43.2 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  40.18 
 
 		 335 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  34.43 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  39.04 
 
 		 333 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.21 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.52 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  36.25 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  38.74 
 
 		 353 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  37.16 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.87 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  39.34 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.61 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.21 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.74 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  39.17 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  31.88 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.43 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  37.01 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.04 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  37.95 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 337 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  38.34 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 391 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  34.81 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.17 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.86 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  37.65 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  40.54 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  36.6 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  38.07 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.59 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.67 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  41.12 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.82 
 
 		 292 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  41.16 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>