More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6728 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6728  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 330 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  58.63 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  59.41 
 
 		 346 aa  352  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  56.55 
 
 		 343 aa  346  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  49.55 
 
 		 352 aa  292  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.96 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0141  transcriptional regulator, LacI family  49.25 
 
 		 352 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0922  regulatory protein LacI  53.87 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000135771  normal  0.0875703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06650  transcriptional regulator, LacI family  48.84 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1201  transcriptional regulator, LacI family  49.72 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1039  transcriptional regulator, LacI family  47.01 
 
 		 335 aa  251  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3360  transcriptional regulator, LacI family  50.66 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0888  transcriptional regulator, LacI family  48.82 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2426  LacI family transcription regulator  42.9 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2180  transcriptional regulator, LacI family  43.79 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000177462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28980  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  30.99 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 		 374 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0580  LacI family response repressor  37.42 
 
 		 352 aa  175  8e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 332 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.03 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  37.15 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  37.15 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.15 
 
 		 346 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  37.58 
 
 		 337 aa  165  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.15 
 
 		 346 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.15 
 
 		 346 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 335 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.15 
 
 		 346 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  37.15 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2681  LacI family transcription regulator  34.08 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2446  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.84 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.39 
 
 		 346 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.65 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3009  transcriptional regulator, LacI family  46.11 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.71 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  34.6 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.63 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  36.58 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  37.2 
 
 		 340 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 342 aa  159  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  35.94 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  36.07 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  35.48 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  37.17 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  36.15 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  36.9 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.51 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  38.08 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  30.86 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  36.05 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.59 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.57 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2540  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.15 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  0.113132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2426  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.15 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.656004  normal  0.991172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2382  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.15 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.824252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  33.22 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  33.22 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  33.22 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.73 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2430  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.15 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.688486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2337  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.15 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3180  HTH-type transcriptional regulator AscG  36.61 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3228  HTH-type transcriptional regulator AscG  36.61 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  36.61 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1562  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.6 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  36.93 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  36.61 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  34.28 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  30.94 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  36.15 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  33.53 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1669  HTH-type transcriptional regulator GalR  33.53 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  33.53 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  33.53 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  33.53 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  36.65 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  36.65 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  36.65 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  33.23 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  32.59 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.48 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.57 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.21 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.53 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.21 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>