More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0734 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
336 aa  693    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  80.6 
 
 
337 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  71.56 
 
 
337 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  74.33 
 
 
336 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  70.36 
 
 
337 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  63.77 
 
 
340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  63.77 
 
 
339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3228  HTH-type transcriptional regulator AscG  63.47 
 
 
339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  64.67 
 
 
338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  63.47 
 
 
340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3180  HTH-type transcriptional regulator AscG  63.47 
 
 
339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  50.45 
 
 
337 aa  325  5e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02564  DNA-binding transcriptional repressor  46.53 
 
 
337 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02529  hypothetical protein  46.53 
 
 
337 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2850  transcriptional regulator AscG  46.53 
 
 
337 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  45.54 
 
 
337 aa  296  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3162  transcriptional regulator AscG  46.22 
 
 
337 aa  295  8e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2838  transcriptional regulator AscG  45.92 
 
 
350 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.106461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3965  transcriptional regulator AscG  45.92 
 
 
350 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0975  transcriptional regulator, LacI family  46.22 
 
 
337 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0998  LacI family transcription regulator  46.22 
 
 
337 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2999  transcriptional regulator AscG  45.92 
 
 
337 aa  293  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1823  transcriptional regulator, LacI family  44.94 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  42.31 
 
 
341 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  43.91 
 
 
344 aa  276  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  43.15 
 
 
344 aa  275  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  41.72 
 
 
341 aa  272  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  43.33 
 
 
336 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  41.12 
 
 
334 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  39.29 
 
 
335 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  38.3 
 
 
352 aa  239  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.7 
 
 
332 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  39.86 
 
 
332 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03325  transcriptional regulator  39.19 
 
 
332 aa  235  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  37.88 
 
 
333 aa  231  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.51 
 
 
342 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 
334 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  37.95 
 
 
334 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.95 
 
 
334 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  37.95 
 
 
334 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.69 
 
 
342 aa  228  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3616  LacI family transcription regulator  40.3 
 
 
345 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 
340 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  39.5 
 
 
327 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  35.67 
 
 
332 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  39.76 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  39.76 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  34.34 
 
 
332 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  37.76 
 
 
343 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  38.18 
 
 
333 aa  215  9e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  39.03 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  38.21 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  39.03 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  38.21 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1669  HTH-type transcriptional regulator GalR  37.91 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  38.51 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  37.91 
 
 
335 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  37.61 
 
 
335 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3524  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 
336 aa  209  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.91 
 
 
332 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03620  hypothetical protein  34.76 
 
 
332 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  37.08 
 
 
328 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  37.08 
 
 
328 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  37.08 
 
 
328 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  37.08 
 
 
336 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0552  transcriptional regulator for galactose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.33 
 
 
334 aa  205  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  35.47 
 
 
333 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3832  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.94 
 
 
339 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  38.74 
 
 
348 aa  202  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.42 
 
 
340 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.42 
 
 
340 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.42 
 
 
340 aa  202  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  36.69 
 
 
334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  38.14 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.34 
 
 
336 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.34 
 
 
336 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3241  DNA-binding transcriptional regulator GalR  38.72 
 
 
342 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000512141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3226  DNA-binding transcriptional regulator GalR  38.72 
 
 
342 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000639669 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3178  DNA-binding transcriptional regulator GalR  38.72 
 
 
342 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3160  DNA-binding transcriptional regulator GalR  38.72 
 
 
342 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.67 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3342  DNA-binding transcriptional regulator GalR  38.72 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0205886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.74 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  35.16 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4106  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.05 
 
 
343 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  hitchhiker  0.000026097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2681  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 
335 aa  195  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0853  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 
343 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2985  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.75 
 
 
343 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0409403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02685  DNA-binding transcriptional repressor  36.45 
 
 
343 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02646  hypothetical protein  36.45 
 
 
343 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3157  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.45 
 
 
343 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0878  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.45 
 
 
343 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 
332 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.45 
 
 
343 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2984  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.45 
 
 
343 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3278  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.86 
 
 
338 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.44 
 
 
346 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.44 
 
 
346 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>