More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4479 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 342 aa  677    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  61.7 
 
 		 391 aa  417  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  47.02 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  47.6 
 
 		 355 aa  291  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  43.84 
 
 		 343 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4738  alanine racemase  47.89 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0343  LacI family transcription regulator  40.84 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0241073  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0927  LacI family transcription regulator  43.38 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.845689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2785  transcriptional regulator of LacI family protein  34.52 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544473  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  39.29 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  35.58 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.76 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.17 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.12 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.35 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  38.51 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.23 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.17 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 342 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  35.86 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 342 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  35.54 
 
 		 339 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  36.53 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  35.37 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.35 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.64 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1502  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.69 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.725302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07090  transcriptional regulator  38.92 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.72012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  35.93 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  31.42 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.03 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.63 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.03 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  33.23 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  33.23 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  31.12 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  33.93 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.64 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 340 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  36.23 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 346 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.93 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.83 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.25 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.74 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.13 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.24 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.64 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  33.94 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.63 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  34.23 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 		 343 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.94 
 
 		 337 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.93 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  34.53 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  40.72 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  30.47 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 336 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.44 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  36.73 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.34 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.65 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.34 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  31.82 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.21 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>