More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0624 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 348 aa  703    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  47.89 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.35 
 
 		 344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  43.54 
 
 		 352 aa  265  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  42.94 
 
 		 352 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.18 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  42.64 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  41.4 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  41 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.62 
 
 		 347 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.82 
 
 		 341 aa  243  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  40.3 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  38.71 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  38.05 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  39 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.67 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  34.72 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  40.67 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  37.05 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  36.8 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  35.35 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  35.05 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3927  LacI family transcription regulator  35.5 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  35.82 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  36.99 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1177  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.06 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  30.65 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 347 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.42 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.42 
 
 		 333 aa  169  8e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 391 aa  169  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.53 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.53 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.12 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  34.43 
 
 		 353 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2271  DNA-binding transcriptional repressor MalI  34.22 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.485606  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 354 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  31.71 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  33.84 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  30.3 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  31 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  31.18 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 342 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  31.18 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  31.18 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  31.18 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.14 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  31.18 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  31.18 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.53 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  33.13 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  29.64 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  32.62 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.4 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  32.52 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  29.7 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  29.39 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3698  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  29.39 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  34.64 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.39 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  30.88 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.39 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  32.22 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  30.88 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  34.44 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.93 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>