More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2271 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2271  DNA-binding transcriptional repressor MalI  100 
 
 		 352 aa  711    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.485606  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  55.79 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1564  DNA-binding transcriptional repressor MalI  59.25 
 
 		 342 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.253156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  55.79 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  55.79 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  55.79 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  55.79 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  55.79 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  55.79 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  55.79 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  55.79 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  54.23 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  54.33 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  42.06 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0983  LacI family transcription regulator  40.18 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  0.446903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1709  maltose regulon regulatory protein MalI  55.37 
 
 		 196 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.616264  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  33.02 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  30.81 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  35.78 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 365 aa  166  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  32.71 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.94 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  32.09 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  31.1 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  32.67 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  31.1 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.08 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0256  regulatory protein, LacI  29.24 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0262  regulatory protein LacI  29.24 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  32.68 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  29.74 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.06 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  30.14 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.68 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.88 
 
 		 386 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.36 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.36 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.2 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  30.52 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  30.9 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  29.87 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.7 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4409  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  30.21 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.82 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  32.5 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.96 
 
 		 340 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  29.89 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  27.63 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.12 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  29.14 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.38 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  31.34 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.07 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.66 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.91 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.18 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.64 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  31.98 
 
 		 352 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  32.15 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  27.88 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  31.13 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1177  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.53 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  30.61 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.38 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  29.75 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.27 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>