More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1564 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1564  DNA-binding transcriptional repressor MalI  100 
 
 		 342 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.253156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  84.8 
 
 		 342 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  84.5 
 
 		 342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  84.5 
 
 		 342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  84.5 
 
 		 342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  84.5 
 
 		 342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  84.5 
 
 		 342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  84.8 
 
 		 342 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  84.21 
 
 		 342 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  84.5 
 
 		 342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  77.19 
 
 		 342 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1709  maltose regulon regulatory protein MalI  99.49 
 
 		 196 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.616264  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2271  DNA-binding transcriptional repressor MalI  59.25 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.485606  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  43.88 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0983  LacI family transcription regulator  36.87 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  0.446903 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.86 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  35.02 
 
 		 357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.12 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.69 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  30.36 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  30.26 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 357 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  29.46 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  29.97 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 348 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  29.68 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.9 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  31.64 
 
 		 365 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.48 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  28.11 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.85 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  28.21 
 
 		 339 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  27.33 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.65 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.98 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.18 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  29.61 
 
 		 340 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  26.85 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  29.23 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  28.26 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  31.17 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.19 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0256  regulatory protein, LacI  28.66 
 
 		 332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0262  regulatory protein LacI  28.66 
 
 		 332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  27.03 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.59 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.17 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  28.95 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.48 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.82 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  30.68 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 349 aa  126  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  27.78 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 342 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  28.08 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 329 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.35 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.43 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4409  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2268  transcriptional regulator, LacI family  29.72 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.7 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  33.99 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  30.93 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  26.17 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.73 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  28.06 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  29.28 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.58 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  30.93 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>