More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1828 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  100 
 
 
342 aa  694    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1564  DNA-binding transcriptional repressor MalI  77.19 
 
 
342 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.253156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  72.81 
 
 
342 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  72.81 
 
 
342 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  72.51 
 
 
342 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  72.51 
 
 
342 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  72.51 
 
 
342 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  72.51 
 
 
342 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  72.51 
 
 
342 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  72.51 
 
 
342 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  72.51 
 
 
342 aa  530  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2271  DNA-binding transcriptional repressor MalI  54.33 
 
 
352 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.485606  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1709  maltose regulon regulatory protein MalI  76.02 
 
 
196 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.616264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  41.79 
 
 
340 aa  289  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 
341 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0983  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 
338 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  0.446903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  33.96 
 
 
357 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  29.88 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 
350 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 
358 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 
339 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.18 
 
 
341 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 
339 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  31.71 
 
 
348 aa  159  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  29.59 
 
 
339 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  30.91 
 
 
326 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 
352 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.71 
 
 
333 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.71 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  30.47 
 
 
351 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.64 
 
 
347 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 
357 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 
339 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 
340 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.13 
 
 
337 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  31.06 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  32.45 
 
 
341 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.54 
 
 
347 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 
343 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.82 
 
 
335 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  28.06 
 
 
331 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 
334 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 
348 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  33.04 
 
 
331 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4409  transcriptional regulator, LacI family  34.9 
 
 
338 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408159  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  32.26 
 
 
339 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  33.85 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  31.06 
 
 
340 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  30.86 
 
 
354 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.01 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  30.03 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  28.27 
 
 
340 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 
339 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 
333 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.47 
 
 
337 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  32.61 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  29.15 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 
358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  30.43 
 
 
356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  32.02 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.33 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  28.41 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  30.93 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  32.06 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 
334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  30.09 
 
 
338 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.08 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  28.36 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  30.15 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.43 
 
 
356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  26.52 
 
 
335 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  25.99 
 
 
333 aa  129  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 
357 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  33.21 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  30.26 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.71 
 
 
332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 
340 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.75 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  28.19 
 
 
347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.16 
 
 
356 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  29.91 
 
 
353 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.06 
 
 
334 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  26.11 
 
 
336 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  31.35 
 
 
346 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  29.79 
 
 
340 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>