More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0983 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0983  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 338 aa  692    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  0.446903 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  41.42 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2271  DNA-binding transcriptional repressor MalI  40.18 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.485606  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  37.39 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  37.39 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  37.39 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  37.39 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  37.39 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  37.39 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  37.39 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  37.39 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1564  DNA-binding transcriptional repressor MalI  36.87 
 
 		 342 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.253156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  34.93 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.34 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.88 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.59 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  31.38 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.54 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  28.96 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  28.36 
 
 		 352 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  32.78 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.78 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.69 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  27.98 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  27.46 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  29.24 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  29.22 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  29.22 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  29.62 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  28.92 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  28.75 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.25 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  28.92 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  29.82 
 
 		 330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  29.22 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  29.22 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  28.34 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 339 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.76 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  28.4 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 358 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  28.61 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  28.87 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1892  transcriptional regulator, LacI family  31.5 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  29.5 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  28.4 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.91 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  28.27 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  28.66 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3312  LacI family transcription regulator  28.45 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.86 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.99 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  29.62 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.44 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  29.86 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  28.7 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  28.11 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.49 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  30.12 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  28.7 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.27 
 
 		 335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  28.82 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 333 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  27.76 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  29.76 
 
 		 338 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  27.33 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  30.16 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.89 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.62 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  28.49 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  28.83 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  28.45 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  25.81 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.96 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>