More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1618 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  100 
 
 		 340 aa  699    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2271  DNA-binding transcriptional repressor MalI  54.23 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.485606  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  43.2 
 
 		 342 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  43.2 
 
 		 342 aa  299  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  43.2 
 
 		 342 aa  299  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  43.2 
 
 		 342 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  43.2 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  43.2 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  43.2 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  43.2 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  43.2 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1564  DNA-binding transcriptional repressor MalI  43.88 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.253156 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  41.79 
 
 		 342 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  40.54 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0983  LacI family transcription regulator  41.42 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  0.446903 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 352 aa  199  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 		 352 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  31.27 
 
 		 351 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  30.27 
 
 		 335 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.97 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.38 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.38 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  29.67 
 
 		 350 aa  185  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  30.33 
 
 		 365 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1709  maltose regulon regulatory protein MalI  44.04 
 
 		 196 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.616264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 333 aa  175  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  29.59 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.75 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  29.59 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 		 352 aa  172  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  28.99 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.86 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.47 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.64 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.09 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.64 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.38 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  30.33 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.02 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  30.58 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.84 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.12 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  31.53 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.64 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  31.53 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.66 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  28.7 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  29.88 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  31.53 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  31.23 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.86 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  31.23 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  31.23 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.49 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  31.18 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  28.36 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  29.55 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  31.23 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  31.23 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  31.23 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.63 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.97 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.15 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  28.7 
 
 		 340 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  28.7 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  28.7 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  28.7 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.44 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  28.7 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  28.7 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  30.65 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  28.7 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  28.7 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  29.03 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>