More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2049 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 352 aa  708    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  99.43 
 
 		 352 aa  705    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  94.03 
 
 		 351 aa  661    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  71.73 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  69.57 
 
 		 357 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  69.82 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  55.32 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  46.04 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.07 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  43.77 
 
 		 357 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  43.37 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  43.54 
 
 		 348 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  40.06 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 339 aa  255  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  41.32 
 
 		 365 aa  249  6e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.51 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.3 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1177  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.69 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  39.45 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  39.14 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  38.84 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  40.07 
 
 		 340 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  37.84 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  40.07 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  38.76 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  38.02 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  38.3 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.94 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  36.96 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3927  LacI family transcription regulator  39.21 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  35.63 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  31.86 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  32.23 
 
 		 338 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.85 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  37.42 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.83 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 368 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.12 
 
 		 336 aa  179  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  35.61 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  34.73 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.15 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 347 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.52 
 
 		 349 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.64 
 
 		 331 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0309  transcriptional regulator, LacI family  36.58 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  34.41 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.55 
 
 		 335 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  32.43 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  31.89 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.13 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  32.43 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  32.13 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  36.25 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  32.43 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  32.13 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  34.66 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  32.13 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  31.74 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.85 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.63 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  32.13 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  32.13 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  31.44 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  31.52 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  31.93 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.83 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.24 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.55 
 
 		 340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  31.21 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  34.94 
 
 		 338 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 		 342 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.53 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28.96 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.93 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.15 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>