More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2686 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 340 aa  695    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  48.96 
 
 		 343 aa  359  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  51.03 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 340 aa  315  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  47.77 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1148  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.62 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.907007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  44.48 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  42.94 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40 
 
 		 342 aa  265  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  42.69 
 
 		 354 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 		 354 aa  255  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1464  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.58 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4307  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.19442  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  36.69 
 
 		 343 aa  231  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1990  alanine racemase  34.91 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01255  putative LacI-family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.83 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.28 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.58 
 
 		 337 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6824  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1423  transcriptional regulator, LacI family  36.75 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.189138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.23 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1151  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.01 
 
 		 344 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.848461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.09 
 
 		 341 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6639  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2268  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.19 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0455476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  38.25 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05070  putative LacI-family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.697537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1404  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.13 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00377783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  36.77 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1259  alanine racemase  33.24 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  36.74 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  36.66 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.53 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  36.42 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  36.42 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  36.1 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  36.1 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  36.1 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  36.1 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.63 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1615  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.76 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  36.42 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  35.78 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.14 
 
 		 338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7004  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000759079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.93 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1526  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 		 353 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.291045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  36.74 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.63 
 
 		 335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  31.94 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  35.22 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.63 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.03 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.63 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  32.44 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  34.99 
 
 		 333 aa  192  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.01 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 368 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  32.76 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.75 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06445  LacI family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  32.12 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.34 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.07 
 
 		 323 aa  189  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  31.33 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.63 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.63 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.93 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.18 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  32.64 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  30.84 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 338 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.23 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 355 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>