More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1067 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 349 aa  705    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  52.69 
 
 		 352 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  53.28 
 
 		 347 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  36.05 
 
 		 347 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  39.03 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  35.6 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.6 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  37.32 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 346 aa  192  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  36.93 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 342 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.26 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.2 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  32.57 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  36.79 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.26 
 
 		 339 aa  186  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  32.75 
 
 		 334 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  32.27 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.62 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.72 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.82 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.9 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  32.08 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  34.49 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  36.78 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.91 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2867  transcriptional regulator, LacI family  36.21 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0458283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.76 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.34 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  35.53 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 342 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  36.73 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  32.58 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  34.86 
 
 		 346 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.59 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  32.02 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  34.5 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  34.5 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  34.5 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  34.5 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.56 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  34.58 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  31.88 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.23 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.36 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  33.8 
 
 		 343 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2719  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.22 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  31.59 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.9 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.13 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  33.81 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.61 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.46 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.61 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01255  putative LacI-family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.77 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.63 
 
 		 337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  32.36 
 
 		 346 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1601  alanine racemase  30.57 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.520299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  31.91 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.64 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.32 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>