More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0466 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 347 aa  704    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  56.89 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  53.28 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  33.24 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.9 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  35.19 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 333 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 334 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  36.2 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 344 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.53 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.59 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.97 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 		 340 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.35 
 
 		 347 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  32.95 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.64 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.37 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.59 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  34.49 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.97 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.5 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.71 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.6 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.93 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.53 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 346 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 345 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  29.53 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.67 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 333 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.67 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  32.93 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.67 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.67 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.63 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  32.01 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  28.4 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  30.77 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.86 
 
 		 336 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  30.27 
 
 		 340 aa  165  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  28.32 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  39.63 
 
 		 350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.05 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.37 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  30.68 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.65 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.16 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  33.23 
 
 		 337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  31.45 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  31.23 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.73 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  31.45 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  31.27 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  32.35 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  29.74 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  29.08 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  34.41 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  29.5 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.37 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2719  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.84 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  30.97 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.18 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.18 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>