More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2268 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2268  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 338 aa  664    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  41.62 
 
 		 347 aa  235  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  43.25 
 
 		 347 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  42.99 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3259  alanine racemase  41.82 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884845  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  38.21 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  38.92 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  36.92 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  38.25 
 
 		 341 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  39.68 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  37.85 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.87 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  38.97 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.35 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  37 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  37.66 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  35.87 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  34.45 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3961  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0946705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4767  transcriptional regulator, LacI family  36.92 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.94 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  35.38 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  31.17 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.17 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.37 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  34.91 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  28.89 
 
 		 336 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  33.76 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.86 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.01 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  32.71 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 356 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.28 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.28 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  32.8 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  32.71 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  32.71 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  32.71 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  33.12 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  33.12 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.94 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.86 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  33.12 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  33.12 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.36 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.69 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  33.86 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.72 
 
 		 348 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.59 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3542  transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.36 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.6 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  29.6 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.6 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.6 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.6 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  29.6 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.23 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.23 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  33.65 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.61 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.61 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.61 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  32.42 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.61 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  32.2 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.61 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.04 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.57 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  32.46 
 
 		 365 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  32.52 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  32.32 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1821  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.94 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  30.42 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>