More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2575 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 340 aa  690    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  56.59 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  43.58 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  40.3 
 
 		 342 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  44.14 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  40.29 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  40.3 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  40 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  40 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  40.3 
 
 		 343 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  40.3 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  40 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  40.3 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  40 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  40 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  38.51 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.31 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.48 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1440  maltose operon repressor MalR, putative  34.12 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  34.33 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  34.33 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.73 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.73 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.73 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.73 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 337 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.13 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1521  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.56 
 
 		 347 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0419  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  33.14 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.63 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  31.18 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.54 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.34 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  28.23 
 
 		 473 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.55 
 
 		 335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  31.86 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.18 
 
 		 340 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  30.25 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  28.96 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  29.46 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  32.44 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.47 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.94 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 341 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  30.18 
 
 		 348 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  32.85 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 341 aa  159  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.47 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  32.37 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  32.34 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1965  transcriptional regulator, LacI family  31.92 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1565  maltose operon transcriptional repressor  28.88 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1596  maltose operon transcriptional repressor  28.88 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  29.19 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1531  LacI family transcription regulator  32.25 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1553  transcriptional regulator, LacI family  31.92 
 
 		 332 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1296  catabolite control protein A  30.75 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>