More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2646 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 350 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  46.88 
 
 		 376 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  44.98 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  41.19 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  42.9 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  44.48 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  43.62 
 
 		 339 aa  232  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  41.49 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  40.65 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  40.67 
 
 		 351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  42.94 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  42.94 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  42.94 
 
 		 329 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  44.18 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0426  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  41.14 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  40.72 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2719  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.14 
 
 		 337 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  38.95 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2305  transcriptional regulator, LacI family  41.86 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.5 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3698  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1943  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 		 347 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2867  transcriptional regulator, LacI family  41.18 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0458283 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.34 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  41 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  38.16 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  36.02 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.44 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.86 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.19 
 
 		 333 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.9 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.93 
 
 		 349 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.45 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.45 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29660  transcriptional regulator, LacI family  40.59 
 
 		 336 aa  189  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.65 
 
 		 335 aa  189  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.12 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  31.12 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.12 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.12 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.12 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.17 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.09 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  35.81 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  37.06 
 
 		 340 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.7 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  38.04 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  37.03 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.33 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  31.4 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  36.64 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.44 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 333 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  36.18 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.78 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.78 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.78 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.78 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.78 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.18 
 
 		 333 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.96 
 
 		 338 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  36.18 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 		 343 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.55 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  38.08 
 
 		 338 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  35.65 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.02 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.05 
 
 		 342 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.05 
 
 		 342 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.72 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  33.88 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.05 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.85 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  35.16 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.08 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  33.73 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.04 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>