More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1481 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0777  LacI transcriptional regulator  53.12 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  44.61 
 
 		 340 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7472  transcriptional regulator LacI family  43.66 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.13 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3686  LacI family transcription regulator  41.95 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3421  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.95 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  40.72 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  37.91 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  37.61 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.39 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 337 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.38 
 
 		 348 aa  218  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.46 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 		 342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 340 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  36.83 
 
 		 338 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  35.33 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  36.99 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.67 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  34.5 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  35.4 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  34.78 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  35.16 
 
 		 331 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  35.19 
 
 		 335 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.96 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.22 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.08 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.18 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.1 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.73 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  34.22 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.11 
 
 		 342 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  34.13 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.06 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.42 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.39 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  33.23 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  32.75 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.69 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.94 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  36.66 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.85 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.94 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  32.49 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.71 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1243  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  32.27 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  35.61 
 
 		 336 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  34.12 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0519  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  35.1 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  32.52 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.84 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.84 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.84 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.19 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.19 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.19 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.19 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.19 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  36.58 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.26 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.91 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.47 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>