More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3400 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
338 aa  654    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  54.27 
 
 
348 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  50.91 
 
 
335 aa  291  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  50.46 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  47.55 
 
 
347 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 
341 aa  271  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  45.85 
 
 
352 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0995  transcriptional regulator, LacI family  50.91 
 
 
349 aa  256  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  47.23 
 
 
342 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  44.61 
 
 
349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  41.87 
 
 
349 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  42.47 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  40.96 
 
 
346 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  38.32 
 
 
346 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  39.63 
 
 
333 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 
346 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  39.1 
 
 
347 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  40.37 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5028  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 
348 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  37.17 
 
 
347 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  39.51 
 
 
354 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.74 
 
 
342 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  38.3 
 
 
353 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  43.36 
 
 
332 aa  188  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  38.58 
 
 
338 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3259  alanine racemase  39.21 
 
 
338 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884845  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.72 
 
 
352 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2013  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 
341 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255214  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  37.58 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2268  transcriptional regulator, LacI family  37.85 
 
 
338 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 
340 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  35.98 
 
 
338 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4767  transcriptional regulator, LacI family  38.79 
 
 
330 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  40.39 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.58 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.87 
 
 
348 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.86 
 
 
335 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 
330 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.61 
 
 
336 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 
342 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  35.93 
 
 
330 aa  175  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.93 
 
 
340 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
342 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  35.06 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 
338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.93 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.64 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 
340 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  38.02 
 
 
337 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 
341 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  37.92 
 
 
326 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 
340 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.94 
 
 
335 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.89 
 
 
335 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 
337 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  36.31 
 
 
334 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  39.21 
 
 
358 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  37.61 
 
 
348 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  36.09 
 
 
336 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  34.76 
 
 
337 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.19 
 
 
342 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.19 
 
 
342 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.45 
 
 
338 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.57 
 
 
343 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  36.92 
 
 
343 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.57 
 
 
343 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.57 
 
 
343 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.57 
 
 
343 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.1 
 
 
356 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  36.25 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.97 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.56 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 
338 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 
335 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.61 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  39.12 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.38 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.48 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  34.55 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.38 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6362  transcriptional regulator, LacI family  32.61 
 
 
349 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  38.02 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  36.59 
 
 
335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 
343 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 
344 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 
343 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 
342 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  36.02 
 
 
365 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 
339 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  35.15 
 
 
334 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0777  LacI transcriptional regulator  34.25 
 
 
337 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  34.85 
 
 
391 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.88 
 
 
348 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.276208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>