More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0014 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 344 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  40.48 
 
 		 381 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  42.64 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  45.29 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  41.62 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  43.95 
 
 		 345 aa  219  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  40.87 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  41.75 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  43.2 
 
 		 348 aa  208  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  39.51 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  41.75 
 
 		 334 aa  206  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  39.74 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  41.95 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  40.39 
 
 		 348 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.42 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  36.96 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.44 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  40.48 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  40.74 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  43.67 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  37.25 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  39.71 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  44.3 
 
 		 357 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  39.1 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  33.75 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 		 336 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  34.43 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  35.05 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  42.47 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 		 361 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.25 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  38.12 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.46 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.64 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  34 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  42 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.92 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.92 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.24 
 
 		 353 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 386 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  34.83 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  36.84 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.24 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.02 
 
 		 337 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  32.95 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  30.82 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1790  transcription regulator protein  37.8 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.678671  normal  0.041815 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  34.01 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.12 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.53 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.61 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.91 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1608  HTH-type transcriptional regulator GalR  31.85 
 
 		 340 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.656083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.79 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  29.91 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  30.21 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  35.52 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  29.91 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28.48 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  31.21 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  29.61 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  32.63 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.72 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  32.2 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  33.44 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  29.91 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  29.91 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.52 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1193  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  39.31 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.61 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.31 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  37.1 
 
 		 346 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>