More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1300 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  100 
 
 		 342 aa  696    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  54.79 
 
 		 337 aa  358  9.999999999999999e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  45.95 
 
 		 347 aa  298  8e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  44.25 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  44.41 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  41.27 
 
 		 352 aa  263  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  40.54 
 
 		 334 aa  248  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  41.27 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 345 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  38.21 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  39.64 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  39.52 
 
 		 338 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  39.7 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  41.78 
 
 		 333 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  41.53 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  39.37 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  36.25 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  39.4 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 465 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  34.88 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  37.22 
 
 		 344 aa  199  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  39.73 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  32.55 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  35.61 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  38.56 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  38.25 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  34.44 
 
 		 337 aa  186  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  36.42 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  33.43 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.35 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  33.23 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  33.75 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  32.62 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 336 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.45 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.45 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.34 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.55 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.91 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  30.84 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  32.14 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.12 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  32.14 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  32.14 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  31.69 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  30.87 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.79 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  31.85 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  33.55 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.33 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  33.05 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.69 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.73 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.59 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.3 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1004  LacI family response repressor  32.2 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.38 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.55 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.43 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.45 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  31.55 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3410  transcriptional regulator, LacI family  32.49 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  30.79 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.03 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  32.47 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.26 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  32.47 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  30.74 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4264  alanine racemase  32.57 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.884026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.71 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  29.83 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3708  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36497  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.23 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.07 
 
 		 331 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>