More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07020 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 345 aa  688    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  65.77 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  61.03 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  49.4 
 
 		 352 aa  325  6e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  52.11 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  53.43 
 
 		 334 aa  312  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  52.73 
 
 		 334 aa  309  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 381 aa  309  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  50.58 
 
 		 348 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  49.25 
 
 		 342 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  49.55 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  47.13 
 
 		 331 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  48.65 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  44.41 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  47.66 
 
 		 350 aa  265  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  46.87 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  48.35 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  44.61 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  47.49 
 
 		 338 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  47.6 
 
 		 333 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  44.21 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  50.68 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 357 aa  238  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  43.07 
 
 		 359 aa  238  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  44.97 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  40.36 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  44.38 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  42.48 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  40.72 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  44.51 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.76 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1004  LacI family response repressor  40.19 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2584  Alanine racemase  42.43 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  39.24 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.63 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  44.41 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02800  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.47 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  35.19 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  37.86 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.37 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  36.7 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  36.93 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  36.93 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.72 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.21 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.74 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 358 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  33.24 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.87 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.08 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.51 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.24 
 
 		 336 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.99 
 
 		 386 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  32.43 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.73 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.43 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.46 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.55 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  33.65 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.45 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.05 
 
 		 333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  32.43 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.12 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  32.43 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  32.8 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  34.87 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0055  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.700788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  35.17 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.01 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 339 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.23 
 
 		 353 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  35.84 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.72 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 358 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>