More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3167 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 357 aa  692    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  52.87 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  46.89 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  50.32 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  46.27 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  46.86 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  43.71 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  45.05 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  47.12 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  46.57 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  47.73 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  44.64 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  46.39 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  45.92 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  48.21 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  45.95 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  39.88 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  44.84 
 
 		 339 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 		 333 aa  209  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 357 aa  206  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  43.71 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  38.54 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  42.72 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  41.84 
 
 		 338 aa  195  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  39.49 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  41.25 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  42.77 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  42.3 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  39.34 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  40.19 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 		 465 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.06 
 
 		 349 aa  167  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  38.19 
 
 		 334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2584  Alanine racemase  39.08 
 
 		 376 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.81 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.25 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  33.04 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  37.06 
 
 		 335 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.42 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  32.84 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.73 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.52 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  32.05 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.38 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  32.53 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  32.53 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  32.74 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  32.23 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  32.23 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.21 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.35 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.88 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.35 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  31.82 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  31.82 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  31.82 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  31.82 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  31.93 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  34.29 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.43 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  31.52 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  31.82 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  31.82 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.56 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0853  transcriptional regulator, LacI family  35.64 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2985  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.64 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02685  DNA-binding transcriptional repressor  35.64 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02646  hypothetical protein  35.64 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4106  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.64 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  hitchhiker  0.000026097 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  31.41 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.73 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.64 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0878  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.64 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2984  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.64 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3157  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.64 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674454  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  29.61 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  31.09 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.48 
 
 		 353 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  35.82 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.56 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  37.82 
 
 		 362 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.55 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  27.6 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1004  LacI family response repressor  33.24 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  31.82 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  34.25 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>