More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1338 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  100 
 
 		 340 aa  695    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  54.97 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  40.46 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  40.31 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 347 aa  206  6e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  38.89 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  39.02 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  34.88 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  38.37 
 
 		 337 aa  192  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  37.5 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  38.18 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1004  LacI family response repressor  38.68 
 
 		 351 aa  186  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  37.57 
 
 		 347 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  39.24 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  33.62 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  37.36 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  36.1 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  35.36 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 341 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.32 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  37.21 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 348 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  36.73 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  34.58 
 
 		 465 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  34.77 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  35.55 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  34.68 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  34.09 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.3 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  33.75 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.27 
 
 		 353 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.96 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  32.23 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  29.36 
 
 		 343 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  29.97 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  32.23 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  32.67 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  32.67 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  32.67 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  32.67 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.82 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  32.67 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.67 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  32.67 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.68 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  34.11 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  32.55 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  34.16 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  30.14 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  29.86 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.97 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  34.1 
 
 		 351 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  31.51 
 
 		 374 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  31.99 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0120  LacI family transcription regulator  33.15 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.76 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.32 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.46 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 343 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  33.99 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  29.68 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  35.39 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.23 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  30.55 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  29.91 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  32.16 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  30.26 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  30.9 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.52 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1537  LacI family response repressor  29.4 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  26.84 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  26.84 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.66 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 355 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>