More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1802 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
339 aa  670    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  56.59 
 
 
381 aa  355  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  56.05 
 
 
342 aa  342  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  54.84 
 
 
348 aa  332  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  53.85 
 
 
331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  55.12 
 
 
347 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  50.6 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  51.03 
 
 
348 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  49.55 
 
 
345 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  50.59 
 
 
344 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  49.71 
 
 
350 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  52.96 
 
 
333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  46.87 
 
 
335 aa  275  9e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  44.38 
 
 
352 aa  268  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  47.34 
 
 
372 aa  265  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  45.83 
 
 
465 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  48.96 
 
 
341 aa  255  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  43.32 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  45 
 
 
341 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  44.01 
 
 
334 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  44.61 
 
 
334 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  44.86 
 
 
357 aa  236  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  39.94 
 
 
342 aa  236  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  40.06 
 
 
337 aa  229  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  43.48 
 
 
359 aa  229  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  46.26 
 
 
336 aa  229  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  45.42 
 
 
357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  42.9 
 
 
351 aa  218  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  41.37 
 
 
338 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  40.75 
 
 
333 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  42.94 
 
 
336 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  42.27 
 
 
353 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  38.18 
 
 
340 aa  194  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  38.08 
 
 
337 aa  193  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  40.48 
 
 
344 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1004  LacI family response repressor  40.43 
 
 
351 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.73 
 
 
330 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.62 
 
 
349 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  45.21 
 
 
339 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  39.71 
 
 
335 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  39.42 
 
 
357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 
332 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  38.82 
 
 
334 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 
332 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.91 
 
 
333 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.72 
 
 
332 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.57 
 
 
339 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.01 
 
 
333 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.01 
 
 
333 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4409  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408159  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.48 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  36.04 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  34.41 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  36.72 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  39.37 
 
 
351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  36.72 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  36.72 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.08 
 
 
337 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 
358 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  36.66 
 
 
340 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  39.55 
 
 
344 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02800  transcriptional regulator  37.71 
 
 
341 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.75 
 
 
342 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.75 
 
 
342 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 
342 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  36.66 
 
 
340 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.38 
 
 
335 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 
353 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  36.42 
 
 
343 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 
346 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 
332 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2584  Alanine racemase  40.46 
 
 
376 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  34.48 
 
 
347 aa  169  9e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 
342 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.12 
 
 
341 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  36.12 
 
 
334 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.63 
 
 
333 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.76 
 
 
335 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.66 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.39 
 
 
341 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  32.39 
 
 
341 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.39 
 
 
341 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.39 
 
 
341 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  32.39 
 
 
341 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.5 
 
 
343 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 
343 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.5 
 
 
343 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.39 
 
 
341 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  36.98 
 
 
326 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 
329 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  34.41 
 
 
334 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 
329 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 
329 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  35.69 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.38 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.64 
 
 
334 aa  165  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>