More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1093 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 351 aa  695    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2503  transcriptional regulator, LacI family  47.15 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  32.11 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 335 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 		 336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.93 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.51 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  38.02 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 353 aa  175  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.85 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.66 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.74 
 
 		 334 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  39.37 
 
 		 339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  36.19 
 
 		 334 aa  166  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 332 aa  166  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.19 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  35.03 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  37.75 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 386 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 330 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0309  transcriptional regulator, LacI family  37.65 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2238  transcriptional regulator, LacI family  35.47 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  35.86 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.28 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  33.05 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.9 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  34.9 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  34.93 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.15 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0309  LacI family transcription regulator  37.22 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  34.1 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  35.98 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  34.1 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  34.1 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.41 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  34.41 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.81 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  35.56 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.41 
 
 		 333 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  34.77 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 		 328 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.57 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  35.29 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  34.02 
 
 		 333 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1637  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.455476 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  36.58 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  38.44 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 349 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6022  LacI family transcription regulator  37.61 
 
 		 337 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 391 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.44 
 
 		 323 aa  156  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  33.82 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4882  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3283  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  36.12 
 
 		 340 aa  155  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.25 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  37.66 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  33.03 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6322  LacI family transcription regulator  36.98 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>