More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2699 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 339 aa  684    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  52.55 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  44.67 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  44.84 
 
 		 346 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  42.48 
 
 		 347 aa  245  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  39.94 
 
 		 331 aa  242  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  39.04 
 
 		 332 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  38.74 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  38.74 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  38.74 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  41.74 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  38.44 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  41.44 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  38.87 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  42.04 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  38.58 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 		 339 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.61 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.83 
 
 		 341 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  39.05 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  40.66 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  40.48 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  36.31 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  40.66 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.97 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.24 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  37.24 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  39.64 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  39.64 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.69 
 
 		 333 aa  226  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 		 343 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.07 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  38.28 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  37.98 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  39.17 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.53 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  40.3 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  39.17 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  37.69 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  40.3 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  37.69 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  37.69 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  40.3 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  40.3 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.04 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  39.94 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  39.94 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  38.28 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  40.76 
 
 		 357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  39.94 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  39.52 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  39.52 
 
 		 343 aa  222  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  38.55 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  38.89 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  37.39 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  36.2 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  37.82 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  37.98 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  35.54 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  40.72 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  37.39 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  37.39 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  37.39 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  35.24 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.25 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0519  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 		 323 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  34.12 
 
 		 334 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.76 
 
 		 333 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  36.95 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  36.95 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  38.28 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  38.21 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  36.95 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  35.59 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  35.59 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  37.76 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  36.95 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  36.66 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  36.66 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  36.66 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  36.66 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  36.36 
 
 		 323 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  38.58 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.95 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  41.54 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>