More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0362 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 337 aa  682    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 		 333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  38.25 
 
 		 332 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  38.37 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  38.06 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  36.61 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  37.16 
 
 		 335 aa  190  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  34.44 
 
 		 342 aa  186  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  38.44 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  36.61 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  35.61 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  35.16 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  35.52 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  37.88 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  37.79 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  34.34 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.85 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.46 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  33.43 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  33.44 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  35.49 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  32.45 
 
 		 391 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  30.57 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  31.36 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  35.16 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1403  LacI family response repressor  30.47 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  30.15 
 
 		 338 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  33.23 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  32.88 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  33.23 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  34.93 
 
 		 336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  30.77 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.13 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1823  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2838  transcriptional regulator AscG  34.39 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02564  DNA-binding transcriptional repressor  34.84 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0975  transcriptional regulator, LacI family  34.84 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02529  hypothetical protein  34.84 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3162  transcriptional regulator AscG  34.84 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.08 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3180  HTH-type transcriptional regulator AscG  32.93 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  32.93 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3228  HTH-type transcriptional regulator AscG  32.93 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0998  LacI family transcription regulator  34.84 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190797 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2850  transcriptional regulator AscG  34.84 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2999  transcriptional regulator AscG  34.84 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3965  transcriptional regulator AscG  34.39 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.93 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.12 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0552  transcriptional regulator for galactose, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.19 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 357 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  32.54 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1537  LacI family response repressor  33.33 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  31.99 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  32.24 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3960  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.97 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.73 
 
 		 335 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  28.79 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>