More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1537 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1537  LacI family response repressor  100 
 
 		 385 aa  783    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1403  LacI family response repressor  36.8 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 336 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  34.13 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.38 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  35.47 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  32.89 
 
 		 342 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  34.11 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  32.1 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  32.81 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  32.89 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  29.95 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  28.72 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  31.4 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  31.65 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  30.97 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  30.59 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  32.81 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  31.67 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  32.81 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  30.4 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  31.15 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.2 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  29.33 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.2 
 
 		 333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  29.4 
 
 		 340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  26.22 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3595  LacI family transcription regulator  31.28 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  30.66 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4772  LacI family transcription regulator  31.28 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0942  LacI family transcription regulator  30.62 
 
 		 340 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  33.85 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5511  LacI family transcription regulator  31.28 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.26 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  26.76 
 
 		 336 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.4 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  32.45 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  27.2 
 
 		 355 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0978  LacI family transcription regulator  28.29 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4679  LacI family transcription regulator  30.11 
 
 		 340 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.705598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  29.6 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  27.73 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  27.85 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36400  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  24.87 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  25.92 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0150  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  29.62 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4155  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.46 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 346 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0597  LacI family transcription regulator  27.16 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.10797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  30.75 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  26.3 
 
 		 331 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1459  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  30.83 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 335 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3432  transcriptional regulator, LacI family  27.01 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000329456  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1004  LacI family response repressor  30.64 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.69 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.16 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1435  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  27.86 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1332  regulatory protein LacI  29.38 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0591  LacI family transcription regulator  27.85 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  28.74 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  27.25 
 
 		 337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.65 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  29.07 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4284  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 328 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  29.89 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  27.87 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>