More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3283 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  100 
 
 
338 aa  706    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  74.03 
 
 
340 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  74.03 
 
 
339 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3180  HTH-type transcriptional regulator AscG  73.73 
 
 
339 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  73.73 
 
 
340 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3228  HTH-type transcriptional regulator AscG  73.73 
 
 
339 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  67.96 
 
 
336 aa  474  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  64.67 
 
 
336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  61.13 
 
 
337 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  63.47 
 
 
337 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  60.83 
 
 
337 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  47.76 
 
 
337 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  46.27 
 
 
337 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  45.29 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02564  DNA-binding transcriptional repressor  42.9 
 
 
337 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3162  transcriptional regulator AscG  42.9 
 
 
337 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  42.56 
 
 
337 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  43.16 
 
 
344 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02529  hypothetical protein  42.9 
 
 
337 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3965  transcriptional regulator AscG  42.9 
 
 
350 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2850  transcriptional regulator AscG  42.9 
 
 
337 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2999  transcriptional regulator AscG  42.9 
 
 
337 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0975  transcriptional regulator, LacI family  42.9 
 
 
337 aa  279  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0998  LacI family transcription regulator  42.9 
 
 
337 aa  279  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  41.18 
 
 
344 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2838  transcriptional regulator AscG  42.3 
 
 
350 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.106461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1823  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 
339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  40.77 
 
 
341 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 
341 aa  256  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  39.58 
 
 
334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  38.18 
 
 
335 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 
340 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  35.95 
 
 
332 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03620  hypothetical protein  35.95 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.16 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 
334 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 
334 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  37.69 
 
 
334 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.39 
 
 
334 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  36.86 
 
 
332 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  37.08 
 
 
352 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.17 
 
 
342 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  38.32 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  38.25 
 
 
334 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  38.25 
 
 
334 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03325  transcriptional regulator  35.95 
 
 
332 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  39.73 
 
 
333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3524  transcriptional regulator, LacI family  35.31 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  37.35 
 
 
335 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  37.35 
 
 
335 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1669  HTH-type transcriptional regulator GalR  37.35 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 
328 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.94 
 
 
328 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  36.94 
 
 
328 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  37.06 
 
 
335 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  37.06 
 
 
335 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3616  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 
345 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  37.16 
 
 
340 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  34.64 
 
 
333 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.84 
 
 
348 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  38.39 
 
 
338 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  38.39 
 
 
338 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.5 
 
 
342 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.14 
 
 
336 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  33.84 
 
 
336 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.04 
 
 
337 aa  202  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1562  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.64 
 
 
345 aa  202  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 
342 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  36.33 
 
 
334 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3832  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.04 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.82 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0853  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4106  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.04 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  hitchhiker  0.000026097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2985  DNA-binding transcriptional regulator GalR  36.04 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0409403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02685  DNA-binding transcriptional repressor  35.74 
 
 
343 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3157  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.74 
 
 
343 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0878  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.74 
 
 
343 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02646  hypothetical protein  35.74 
 
 
343 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.74 
 
 
343 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2984  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.74 
 
 
343 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  35.54 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.54 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.54 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  35.54 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.54 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 
346 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 
343 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.24 
 
 
346 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2540  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.35 
 
 
340 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  0.113132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2426  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.35 
 
 
340 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.656004  normal  0.991172 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.93 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0552  transcriptional regulator for galactose, periplasmic binding protein, LacI family protein  31.31 
 
 
334 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  33.54 
 
 
333 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.93 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3278  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.29 
 
 
338 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.93 
 
 
340 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2430  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.05 
 
 
340 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.688486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2382  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.05 
 
 
340 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.824252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>