More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2262 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 336 aa  661    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  45.88 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  45.92 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  44.41 
 
 		 348 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  45.35 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  42.9 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  44.81 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  45.51 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  46.98 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  43.75 
 
 		 342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  44.84 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  41.14 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  46.39 
 
 		 357 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  43.58 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  42.34 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  42.04 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 333 aa  208  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  46.44 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  38.35 
 
 		 352 aa  205  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  39.05 
 
 		 337 aa  205  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  41.32 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  37.13 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  41.31 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  41.32 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  39.59 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  41.1 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  44.31 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  38.87 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  41.14 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  35.59 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  39.82 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.86 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  37.03 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  38.32 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.73 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  38.69 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  33.04 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  33.04 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  33.04 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.33 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.04 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.04 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.04 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.04 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.46 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.75 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.04 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.51 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  39.47 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  36.23 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.01 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  34.13 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1004  LacI family response repressor  35.4 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  30.47 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  34.89 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  42.76 
 
 		 339 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  36.58 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2999  transcriptional regulator AscG  35.4 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0975  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.48 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0998  LacI family transcription regulator  35.4 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3965  transcriptional regulator AscG  35.4 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2850  transcriptional regulator AscG  35.4 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02564  DNA-binding transcriptional repressor  35.4 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02529  hypothetical protein  35.4 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3162  transcriptional regulator AscG  35.4 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  34.71 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2838  transcriptional regulator AscG  34.78 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106461 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.06 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.03 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  34.27 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.38 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.63 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  32.74 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  36.19 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1823  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.83 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  33.76 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  36.92 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  34.5 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.07 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>