More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0577 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0577  LacI family transcription regulator  100 
 
 
344 aa  706    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.868296  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1823  transcriptional regulator, LacI family  68.84 
 
 
339 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3187  LacI family transcription regulator  69.05 
 
 
337 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0975  transcriptional regulator, LacI family  62.46 
 
 
337 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818441  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3162  transcriptional regulator AscG  62.16 
 
 
337 aa  434  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2999  transcriptional regulator AscG  62.46 
 
 
337 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0998  LacI family transcription regulator  62.46 
 
 
337 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02564  DNA-binding transcriptional repressor  61.86 
 
 
337 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2850  transcriptional regulator AscG  61.86 
 
 
337 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02529  hypothetical protein  61.86 
 
 
337 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2838  transcriptional regulator AscG  61.56 
 
 
350 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.106461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  62.2 
 
 
341 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3965  transcriptional regulator AscG  61.86 
 
 
350 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  61.61 
 
 
341 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  55.22 
 
 
337 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  54.93 
 
 
337 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  44.64 
 
 
336 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  44.25 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  43.92 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  41.18 
 
 
338 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  43.15 
 
 
336 aa  275  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  42.56 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  41.25 
 
 
340 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  41.25 
 
 
339 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3228  HTH-type transcriptional regulator AscG  40.95 
 
 
339 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000212172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3180  HTH-type transcriptional regulator AscG  40.95 
 
 
339 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  40.95 
 
 
340 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  37.76 
 
 
344 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  35.06 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  40.2 
 
 
327 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03620  hypothetical protein  34.55 
 
 
332 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  35.81 
 
 
340 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0708  HTH-type transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 
336 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.94 
 
 
332 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3616  LacI family transcription regulator  35.54 
 
 
345 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.05 
 
 
334 aa  202  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.54 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.24 
 
 
336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.97 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.65 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.65 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  33.94 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 
333 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4325  LacI family transcription regulator  32.35 
 
 
351 aa  192  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  37.87 
 
 
332 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  34.53 
 
 
338 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  34.53 
 
 
338 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.14 
 
 
334 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 
334 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  34.14 
 
 
334 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  34.14 
 
 
334 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  34.56 
 
 
333 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 
335 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.52 
 
 
346 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3331  regulatory protein LacI  37.39 
 
 
334 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1078  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 
334 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.69 
 
 
340 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.24 
 
 
325 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  32.04 
 
 
352 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.01 
 
 
336 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1562  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.86 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1112  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0361448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.52 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 
329 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 
336 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  35.93 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.93 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  35.93 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03325  transcriptional regulator  35.57 
 
 
332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.93 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.93 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.93 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  35.93 
 
 
346 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.91 
 
 
348 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  33.73 
 
 
333 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.23 
 
 
340 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.23 
 
 
340 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.23 
 
 
340 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2382  DNA-binding transcriptional regulator GalS  33.93 
 
 
340 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.824252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2426  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.23 
 
 
340 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.656004  normal  0.991172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2540  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.23 
 
 
340 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182428  normal  0.113132 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2430  DNA-binding transcriptional regulator GalS  33.93 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.688486  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.55 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2446  DNA-binding transcriptional regulator GalS  35.63 
 
 
346 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2337  DNA-binding transcriptional regulator GalS  33.93 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 
337 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 
344 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.74 
 
 
342 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0745  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.57 
 
 
337 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1788  HTH-type transcriptional regulator GalR  32.35 
 
 
335 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1669  HTH-type transcriptional regulator GalR  32.35 
 
 
335 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1732  HTH-type transcriptional regulator GalR  32.35 
 
 
335 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1610  HTH-type transcriptional regulator GalR  32.35 
 
 
335 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.578137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  36.23 
 
 
333 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1667  HTH-type transcriptional regulator GalR  32.35 
 
 
335 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0552  transcriptional regulator for galactose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.53 
 
 
334 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 
335 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>