More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0056 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 335 aa  655    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  72.81 
 
 		 334 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  42.09 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  37.54 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 381 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  41.52 
 
 		 345 aa  189  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  39.62 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  39.22 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  38.53 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  37.65 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  36.31 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  42.64 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  35.78 
 
 		 352 aa  175  9e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  39.19 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  39.41 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  39.05 
 
 		 351 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 333 aa  169  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  39.48 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  37.21 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  32.74 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  37.94 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07780  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.8 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  38.32 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0362  transcriptional regulator, LacI family  35.17 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2783  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.990629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  36.48 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.63 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  37.06 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.52 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.52 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  37.43 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.53 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  36.71 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  32.94 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.94 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  35.94 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 332 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  38.07 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  31.29 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  35.86 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  30.99 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1164  LacI family transcription regulator  29.53 
 
 		 344 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 		 359 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.75 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  36.76 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.45 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  33.62 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.71 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.86 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  37.22 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  26.74 
 
 		 346 aa  132  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  31.01 
 
 		 347 aa  132  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  34.02 
 
 		 355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  30.12 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  32.14 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  31.42 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02800  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  31.75 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  35.55 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  33.61 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  35.96 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  30.06 
 
 		 366 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6940  LacI family transcription regulator  31.12 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634122  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>