More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1860 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 338 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  56.36 
 
 		 336 aa  342  7e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  55.56 
 
 		 348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  53.01 
 
 		 340 aa  328  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  52.57 
 
 		 359 aa  326  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  52.23 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  53.05 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  52.63 
 
 		 328 aa  316  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  53.25 
 
 		 346 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  53.47 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  50.76 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  49.85 
 
 		 351 aa  279  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  52.85 
 
 		 333 aa  278  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  49.1 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  46.71 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  50 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  47.18 
 
 		 342 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  46.99 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  45.37 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  46.22 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  47.2 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  44.74 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  43.11 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  47.01 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  46.97 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  43.94 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  45.18 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  42.23 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  40.49 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  42.52 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  37.54 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  36.86 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  43.71 
 
 		 345 aa  209  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  42.34 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  37.2 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  37.88 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  43.26 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  36.96 
 
 		 371 aa  192  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  36.54 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  33.13 
 
 		 357 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  33.13 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  33.13 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  35.22 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  36.34 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 		 343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  33.33 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  34.63 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  34.14 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 363 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  34.14 
 
 		 363 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  34.44 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  34.44 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  34.44 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  34.44 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  34.63 
 
 		 363 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0572  LacI family response repressor  36.89 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.379149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  37.35 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  37.24 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  36.25 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  37.05 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  36.14 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  36.14 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  36.14 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  37.43 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.04 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  33.03 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  36.45 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 		 353 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.95 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  37.54 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  37.27 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  37.54 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  37.54 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  37.54 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.47 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.45 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.15 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.4 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  36.45 
 
 		 337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>