More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02800  transcriptional regulator  100 
 
 		 341 aa  650    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0055  transcriptional regulator, LacI family  67.95 
 
 		 323 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.700788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  42.77 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  38.97 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07020  transcriptional regulator, LacI family  41.21 
 
 		 345 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0408  transcriptional regulator, LacI family  41.38 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  37.97 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  38.29 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2486  ribose operon repressor RbsR  38.37 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008295 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11680  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1802  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1871  transcriptional regulator, LacI family  42.2 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  38.53 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03100  transcriptional regulator, LacI family  40.4 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0219145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1926  transcriptional regulator, LacI family  37.68 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0385  transcriptional regulator, LacI family  36.16 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0775  Alanine racemase  39.71 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  hitchhiker  0.00169568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0228  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  35.51 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1038  Alanine racemase  37.5 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.255953  normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29310  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  34.1 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  39.2 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3896  transcriptional regulator, LacI family  35.92 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.469202 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.99 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  32.86 
 
 		 339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.71 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  36.99 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1087  transcriptional regulator, LacI family  38.27 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1300  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  32.52 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1545  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  33.23 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0174364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02810  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.26 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1520  transcriptional regulator, LacI family  37.77 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0056  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1111  LacI family transcription regulator  30.46 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.89 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.76 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  30.11 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1740  RbsR family transcriptional regulator/ribose operon repressor  32.47 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.214508  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  30.7 
 
 		 340 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0925  RbsR family transcriptional regulator/Ribose operon repressor  34.01 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.197996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3167  transcriptional regulator, LacI family  39.14 
 
 		 357 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.61 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1338  LacI family response repressor  32.1 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.62 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  34.39 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.52 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.91 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  30.81 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.09 
 
 		 341 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  26.59 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  30.52 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2262  transcriptional regulator, LacI family  37.25 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.638644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  30.61 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  30.52 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  30.52 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.74 
 
 		 341 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  30.61 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  30.61 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  36.18 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2581  LacI family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.86 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  30.23 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.99 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3245  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 344 aa  126  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  32.87 
 
 		 355 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  30.32 
 
 		 330 aa  126  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.22 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  31.93 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.56 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  30.61 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  30.61 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6940  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634122  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.75 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  35.96 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  29.43 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  27.6 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>