More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4705 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 359 aa  716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  58.97 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  52.87 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  56.72 
 
 		 340 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  54.12 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  49.86 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  53.04 
 
 		 346 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  52.57 
 
 		 338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  52.68 
 
 		 346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  46.29 
 
 		 351 aa  291  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  49.02 
 
 		 339 aa  289  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  51.97 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  49.17 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  45.53 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  43.43 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  45.01 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  44.66 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  45.63 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  47.92 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  41.36 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  46.41 
 
 		 359 aa  242  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 362 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 		 359 aa  238  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  42.5 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  45.07 
 
 		 352 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  40.17 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  39.43 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  40.94 
 
 		 342 aa  223  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  43.61 
 
 		 340 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  36.1 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  39.32 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  42.62 
 
 		 342 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  42.22 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  36.6 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  38.16 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  36.36 
 
 		 358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  36.04 
 
 		 358 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  36.18 
 
 		 357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  40.32 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0817  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.533751  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0572  LacI family response repressor  35.96 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.379149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  36.01 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  35.39 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  33.33 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.96 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 348 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  29.32 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  34.22 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  30.17 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  34.22 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  34.22 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  36.48 
 
 		 339 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  34.97 
 
 		 360 aa  166  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.23 
 
 		 336 aa  166  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  34.64 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  34.64 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  34.64 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  34.64 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  34.64 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  34.64 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  34.64 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  34.31 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  38.69 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  35.22 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  38.01 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.26 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  34.54 
 
 		 363 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  33.99 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.77 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.3 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.92 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.12 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.36 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.76 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.59 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  36.21 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  33.77 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  33.99 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  34.84 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  36.21 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  32.68 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  34.7 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.77 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.33 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30.25 
 
 		 355 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  32.57 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  38.2 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.57 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>