More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3394 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  100 
 
 		 361 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  71 
 
 		 331 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  71.9 
 
 		 331 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  58.31 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  55.59 
 
 		 335 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 340 aa  299  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  50.15 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  48.49 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  49.42 
 
 		 348 aa  288  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  48.05 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  50.45 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  50 
 
 		 473 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  50.45 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  49.42 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  47.48 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  46.47 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  47.2 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  46.02 
 
 		 343 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  51.98 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  44.71 
 
 		 337 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  47.95 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  47.27 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  47.63 
 
 		 346 aa  248  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  47.76 
 
 		 343 aa  245  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  46.18 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  47.73 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  44.83 
 
 		 351 aa  242  7.999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  46.55 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  40.61 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  47.28 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  46.49 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  42.3 
 
 		 338 aa  232  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  44.15 
 
 		 357 aa  232  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  44.88 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  46.06 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  44.87 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  41.99 
 
 		 342 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.76 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  40.6 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  39.87 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  40.3 
 
 		 339 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.76 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.92 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.29 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 		 329 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  42.9 
 
 		 334 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  41.37 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  36.55 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.93 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  36.36 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  36.64 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.92 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  40.72 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  33.23 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.66 
 
 		 368 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.3 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  35.48 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.44 
 
 		 337 aa  172  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  32.12 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.73 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  34.23 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.74 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.34 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  38 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  37.09 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  32.27 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  34.2 
 
 		 343 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  35.09 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.06 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  30.08 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  36.27 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.64 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  32.15 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  32.27 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>