More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7169 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  100 
 
 		 331 aa  648    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  79.46 
 
 		 331 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  71.9 
 
 		 361 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  62.24 
 
 		 335 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  58.91 
 
 		 335 aa  371  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  52.57 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  53.15 
 
 		 340 aa  315  7e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  52.41 
 
 		 335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  53.1 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  55.56 
 
 		 343 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  52.51 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  50.89 
 
 		 344 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  51.8 
 
 		 473 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  49.55 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  53.8 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  48.51 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  50.6 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  50.74 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  52.25 
 
 		 338 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  45.62 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  50.45 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  50.6 
 
 		 346 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  47.65 
 
 		 350 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  46.87 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  47.84 
 
 		 351 aa  262  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  47.16 
 
 		 343 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  48.64 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  48.08 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  48.5 
 
 		 357 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  44.71 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  47.85 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  41.84 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  48.8 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  45.18 
 
 		 350 aa  228  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  45.26 
 
 		 337 aa  225  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  44.11 
 
 		 359 aa  225  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  38.17 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  41.99 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  37.2 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.61 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  37.2 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  39.1 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  36.52 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  41.62 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  38.02 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  40.18 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.24 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  35.98 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 335 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.46 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 329 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  34.64 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  36.64 
 
 		 335 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 334 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.65 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.13 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  32.73 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  36.18 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.53 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.76 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  39.23 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  37.06 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  32.73 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.75 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  41.08 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  35.47 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  40.72 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.1 
 
 		 335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3471  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 		 337 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.413963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.94 
 
 		 330 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  38.64 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.84 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>