More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1193 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
335 aa  638    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  65.87 
 
 
337 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  45.43 
 
 
351 aa  239  6.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  46.18 
 
 
351 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  44.41 
 
 
350 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  44.88 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  41.18 
 
 
350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  42.07 
 
 
343 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 
346 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  41.79 
 
 
343 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  40.72 
 
 
340 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  42.69 
 
 
331 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  40.65 
 
 
344 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  44.35 
 
 
335 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  41.49 
 
 
473 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.32 
 
 
335 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  42.51 
 
 
339 aa  198  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  40.65 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  39.7 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  39.46 
 
 
338 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  39.16 
 
 
340 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  42.43 
 
 
343 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  44.38 
 
 
339 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  41.44 
 
 
350 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  39.1 
 
 
335 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  43.33 
 
 
331 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.87 
 
 
348 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  41.37 
 
 
361 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  44.58 
 
 
338 aa  185  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  42.43 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  44.23 
 
 
337 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  40.95 
 
 
344 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  41.99 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 
337 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  39.29 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 
337 aa  178  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  40.36 
 
 
359 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 
329 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 
337 aa  170  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 
332 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  38.02 
 
 
357 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  41.57 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 
338 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.52 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  33.04 
 
 
333 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.43 
 
 
337 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.23 
 
 
336 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 
347 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 
342 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  30.88 
 
 
324 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 
332 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.84 
 
 
339 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.93 
 
 
333 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  31.04 
 
 
339 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.44 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 
341 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 
335 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  28.66 
 
 
342 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 
353 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 
341 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.43 
 
 
333 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  36.07 
 
 
334 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  28.96 
 
 
343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 
343 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.43 
 
 
353 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  38.6 
 
 
351 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  32.56 
 
 
343 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 
391 aa  149  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 
338 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  28.36 
 
 
340 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  38.28 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  28.36 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  29.74 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  28.36 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  28.36 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  28.36 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  28.36 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  28.36 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.29 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  28.36 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  35.88 
 
 
351 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 
344 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  28.06 
 
 
343 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 
348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  28.48 
 
 
327 aa  146  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  27.79 
 
 
336 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  30.95 
 
 
331 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  29.88 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.6 
 
 
336 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  27.13 
 
 
346 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.58 
 
 
292 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  36.07 
 
 
334 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
361 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.53 
 
 
328 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  29.22 
 
 
323 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>