More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0325 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  91.04 
 
 		 335 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  63.75 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  58.91 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  56.55 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 339 aa  358  8e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  55.59 
 
 		 361 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  56.46 
 
 		 340 aa  342  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  55.92 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  54.55 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  56.8 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  52.51 
 
 		 338 aa  322  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  54.6 
 
 		 344 aa  318  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  53.75 
 
 		 343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  51.93 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  51.8 
 
 		 473 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  51.79 
 
 		 344 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  54.41 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  52.1 
 
 		 339 aa  299  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  51.17 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  51.51 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  48.8 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 		 338 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  46.73 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  49.25 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  47.76 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  45.03 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  47.91 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  48.22 
 
 		 343 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  46.01 
 
 		 351 aa  241  9e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  43.81 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  45.4 
 
 		 357 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  47.49 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  44.88 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  47.87 
 
 		 349 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  46.55 
 
 		 350 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  42.69 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  45.15 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  43.58 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.63 
 
 		 336 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  43.32 
 
 		 335 aa  195  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.65 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  39.34 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  42.73 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  42.17 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.63 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  37.33 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 		 329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.32 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.05 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  37.86 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  38.41 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.76 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  34.82 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  37.16 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.34 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  32.13 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.83 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3834  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.33 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  37.09 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  34.34 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3243  HTH-type transcriptional regulator AscG  33.93 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000054765 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.67 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2142  transcriptional regulator, LacI family  32.23 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  34.93 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3344  HTH-type transcriptional regulator AscG  33.93 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.718161  normal  0.0271899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  36.23 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  32.32 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.6 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2483  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  36.9 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  34.23 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  30.84 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  38.21 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3162  HTH-type transcriptional regulator AscG  33.63 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>