More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  100 
 
 		 351 aa  684    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 		 337 aa  265  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  46.29 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  43.58 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  43.24 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.89 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  42.57 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  42.18 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  40.38 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  39.12 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  40.76 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  39.12 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  40.06 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  41.19 
 
 		 345 aa  192  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  40.45 
 
 		 346 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  40.65 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  42.43 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  41.61 
 
 		 351 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  40.2 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.71 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  35.86 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  39.35 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  39.94 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  38.71 
 
 		 348 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  36.95 
 
 		 344 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  39.36 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  37.2 
 
 		 473 aa  175  9e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  38.18 
 
 		 349 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  36.21 
 
 		 357 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  36.26 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  37.71 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  29.65 
 
 		 324 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.44 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  36.71 
 
 		 339 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  38.6 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  38.05 
 
 		 372 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.82 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  35.38 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  37.86 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  30.54 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.27 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  32.35 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.01 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.68 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  37.9 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.62 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3529  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2960  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.430193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.1 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  33.91 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  27.83 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3688  LacI family transcription regulator  36.02 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.73 
 
 		 353 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4990  transcriptional regulator, LacI family  36.03 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0202864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  30.47 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 		 353 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.43 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.69 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.01 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.12 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  29.91 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  32.47 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 334 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  28.74 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4363  LacI family transcription regulator  33.91 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000162438  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  32.94 
 
 		 334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2785  transcriptional regulator of LacI family protein  28.45 
 
 		 350 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544473  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  34.68 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4321  transcriptional regulator, LacI family  34.76 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794794  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  28.74 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0303  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>