More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2785 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2785  transcriptional regulator of LacI family protein  100 
 
 		 350 aa  718    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544473  normal  0.623487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  34.78 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  34.52 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 		 391 aa  215  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 		 365 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0927  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.845689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4738  alanine racemase  33.23 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0343  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0241073  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  29.97 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  31.33 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  30.97 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  29.76 
 
 		 340 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  28.32 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  28.24 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  29.38 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.53 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  29.59 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 371 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3376  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  29.46 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2534  transcriptional regulator, LacI family  27.09 
 
 		 663 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  28.66 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.69 
 
 		 355 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  29.76 
 
 		 338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  31.47 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  30.31 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  29.73 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  28.7 
 
 		 347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.14 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  27.54 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  27.86 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  27.84 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  27.84 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  27.84 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.97 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.09 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  30.18 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3173  transcriptional regulator, LacI family  29.84 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.579609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  29.26 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  26.19 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.18 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  29.24 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3340  LacI family transcription regulator  27.89 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1754  transcriptional regulator, LacI family  29.52 
 
 		 344 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000321603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  27.84 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  27.65 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  31.14 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  31.07 
 
 		 330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  26.55 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  27.22 
 
 		 346 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  30.26 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1459  LacI family transcription regulator  29.51 
 
 		 340 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0256  regulatory protein, LacI  30.15 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0262  regulatory protein LacI  30.15 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  26.96 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  28.9 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1145  LacI family transcription regulator  27.84 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.82 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.45 
 
 		 337 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6517  putative transcriptional regulator, LacI family protein  27.04 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  28.28 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  28.4 
 
 		 344 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  28.82 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.41 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.41 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.84 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.81 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7472  transcriptional regulator LacI family  27.92 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  27.03 
 
 		 335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  27.59 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  26.71 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.94 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  27.25 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  27.87 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  29.39 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  29.68 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  26.33 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  29.39 
 
 		 343 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 340 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  29.8 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  28.06 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2386  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737452  normal  0.472555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>