More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1687 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 360 aa  736    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1686  LacI family transcription regulator  50.46 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0533  LacI family transcription regulator  48.41 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.985534  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0899  LacI family transcription regulator  44.25 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2386  LacI family transcription regulator  39.29 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737452  normal  0.472555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  37.79 
 
 		 381 aa  232  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.21 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.5 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.83 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  34.2 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  33.23 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.01 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  34.42 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  34.42 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  34.42 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.67 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.59 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.47 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.52 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.06 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 		 342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  33.04 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.05 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  33.04 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  31.95 
 
 		 349 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.35 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 348 aa  162  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 		 391 aa  162  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.16 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.29 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  32.55 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  31.53 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  33.92 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  35.18 
 
 		 339 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  35.21 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.46 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.82 
 
 		 337 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  34.67 
 
 		 336 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  31.64 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.24 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.88 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  30.24 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 331 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  31.41 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1905  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  31.36 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  32.64 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  34.63 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.73 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  33.62 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  33.62 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.34 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.34 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.93 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  31.98 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  28.78 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  31.29 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  28.83 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.95 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  29.46 
 
 		 331 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.56 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  30.27 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.1 
 
 		 336 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  34.78 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  31.52 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  31.66 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>