More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0292 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
336 aa  666    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  71 
 
 
361 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  68.77 
 
 
364 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6854  transcriptional regulator, LacI family  52.13 
 
 
330 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000835434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0032  Alanine racemase  49.85 
 
 
329 aa  265  8e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19154  normal  0.0639211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  46.39 
 
 
346 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  46.45 
 
 
336 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0956  transcriptional regulator, LacI family  44.04 
 
 
326 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1984  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.34 
 
 
346 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.016252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  40 
 
 
348 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.74 
 
 
353 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  37.88 
 
 
335 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 
340 aa  205  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4618  regulatory protein LacI  41.82 
 
 
332 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 
334 aa  203  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 
347 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0663  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
326 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  37.72 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  38.48 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.46 
 
 
341 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.97 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  38.17 
 
 
341 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  38.17 
 
 
341 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 
339 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  38.17 
 
 
341 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.17 
 
 
341 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.17 
 
 
341 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.17 
 
 
341 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.17 
 
 
341 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.17 
 
 
341 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.37 
 
 
331 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  38.99 
 
 
340 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0436  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 
341 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197252  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  40.72 
 
 
339 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.95 
 
 
328 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  39.1 
 
 
346 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  36.61 
 
 
332 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.46 
 
 
341 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  36.72 
 
 
338 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.46 
 
 
341 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  37.54 
 
 
331 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.46 
 
 
341 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.46 
 
 
341 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  38.46 
 
 
341 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.58 
 
 
335 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2876  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 
342 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.900808  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 
346 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  38.1 
 
 
336 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.38 
 
 
342 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0425  LacI family transcription regulator  40.47 
 
 
364 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.888688  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 
341 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  39.12 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  39.82 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.64 
 
 
336 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  38.1 
 
 
340 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.84 
 
 
352 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  37.27 
 
 
361 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.54 
 
 
337 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  39.76 
 
 
337 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  40 
 
 
351 aa  187  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  35.59 
 
 
341 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  37.09 
 
 
341 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  34.35 
 
 
334 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  35.47 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.88 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  38.53 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  39.64 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  35 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  35.47 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  35.47 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  34.83 
 
 
340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.69 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  34.35 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.12 
 
 
341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  35.17 
 
 
330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.12 
 
 
341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.12 
 
 
341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  35.47 
 
 
330 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  35.47 
 
 
330 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  35.47 
 
 
330 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2472  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
339 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63522  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  35.24 
 
 
332 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  35.24 
 
 
332 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3611  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.87 
 
 
345 aa  182  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  37.99 
 
 
334 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  38.86 
 
 
346 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 
357 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  34.83 
 
 
336 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.12 
 
 
341 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  39.71 
 
 
343 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  35.24 
 
 
332 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  39.71 
 
 
343 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  39.71 
 
 
343 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  39.71 
 
 
343 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  38.37 
 
 
330 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.03 
 
 
341 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>