More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1125 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 341 aa  669    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  70.12 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  64.92 
 
 		 331 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  62.61 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  64.05 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  62.61 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2073  transcriptional regulator, LacI family  62.69 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000787477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  62.2 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  42.47 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  47.09 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  40.9 
 
 		 353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  41.96 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  37.43 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 342 aa  209  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  42.26 
 
 		 347 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  41.87 
 
 		 353 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.66 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0461  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  39.41 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.09 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  39.47 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  34.73 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  37.2 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 335 aa  192  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  38.42 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.63 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.43 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.43 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.53 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.24 
 
 		 335 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2445  LacI family transcription regulator  37.2 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.24 
 
 		 335 aa  189  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2344  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 		 349 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.94 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.47 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.47 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.47 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  34.83 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.47 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  34.83 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.47 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  39.34 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  34.83 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  35.74 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  34.74 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  34.83 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  34.8 
 
 		 332 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  34.53 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  34.83 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0181  transcriptional regulator, LacI family  40.76 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  38.48 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  39.47 
 
 		 340 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.14 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  34.8 
 
 		 333 aa  182  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.73 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  34.53 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  36.89 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  34.53 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  34.44 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33130  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 		 361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.260263  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.73 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.65 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  34.65 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  34.65 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  38.87 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.65 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.65 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.65 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.65 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.65 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.13 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.65 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  34.48 
 
 		 332 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  33.73 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.17 
 
 		 332 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  39.1 
 
 		 331 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3482  Alanine racemase  40.8 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.24 
 
 		 337 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.83 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.54 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  34.14 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  36.98 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  36.25 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0245  LacI family transcription regulator  39.87 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>