More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0052 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 364 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  68.1 
 
 		 350 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  68.1 
 
 		 350 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0313  transcriptional regulator, LacI family  59.58 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7053  LacI family transcription regulator  54.31 
 
 		 350 aa  358  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  51.75 
 
 		 348 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  44.18 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0397  LacI family transcription regulator  44.83 
 
 		 371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  43.52 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7040  LacI family transcription regulator  45.24 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7045  LacI family transcription regulator  40.77 
 
 		 340 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0429  LacI family transcription regulator  39.6 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17860  transcriptional regulator  39.94 
 
 		 339 aa  235  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.6068  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  40.99 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3139  LacI family transcription regulator  38.29 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3267  transcriptional regulator, LacI family  37.57 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0125  LacI family response repressor  40.95 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.258556  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  35.96 
 
 		 361 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4741  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.1 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2373  LacI family transcription regulator  35.48 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4706  transcriptional regulator, LacI family  36.57 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4598  transcriptional regulator, LacI family  36.81 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0382  transcriptional regulator, LacI family  36.1 
 
 		 360 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5743  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1359  LacI family transcription regulator  36.89 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.343694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1962  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 352 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 341 aa  189  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2027  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.23 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.571384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 337 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  36.1 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3243  LacI family transcription regulator  35.29 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.65 
 
 		 330 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  33.73 
 
 		 334 aa  176  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.67 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3366  transcriptional regulator, LacI family  37.68 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.621773  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.88 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4870  transcriptional regulator, LacI family  36.91 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  34.9 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  32.75 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0233  regulatory protein LacI  33.14 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  32.92 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  31.14 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0825  transcriptional regulator, LacI family  35.73 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  32.35 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.44 
 
 		 331 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3304  transcriptional regulator, LacI family  37.19 
 
 		 358 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000642763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  34.08 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.71 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.52 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.08 
 
 		 336 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  33.76 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.65 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  30.68 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4680  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3298  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  36.59 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.04 
 
 		 341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  34.12 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  34.47 
 
 		 366 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 346 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  36.52 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  36.26 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.74 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.94 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  34.93 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.13 
 
 		 341 aa  160  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.15 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.24 
 
 		 328 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  34.86 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  30.97 
 
 		 334 aa  159  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  35.65 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  31.66 
 
 		 334 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  33.33 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  33.12 
 
 		 341 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.59 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  31.3 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  33.62 
 
 		 354 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  34 
 
 		 347 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  29.88 
 
 		 336 aa  157  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.87 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>