More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0219 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 351 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  77.38 
 
 		 339 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  53.64 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  52.57 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  50.9 
 
 		 333 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  51.92 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  52.15 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  50.61 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  50.92 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  46.29 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  51.38 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  47.88 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  45.21 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  48.38 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  47.02 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  50 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  48.63 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  47.81 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  43.38 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  42.65 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  42.69 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  44.81 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  44.74 
 
 		 346 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  40.92 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 362 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  44.11 
 
 		 352 aa  239  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  39.02 
 
 		 358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  38.53 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  38.6 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 340 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  40.42 
 
 		 357 aa  229  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  42.64 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  38.51 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  39.27 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  37.91 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  37.91 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  37.91 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  37.91 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  37.91 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  40.6 
 
 		 353 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  37.61 
 
 		 363 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  37.91 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  37.61 
 
 		 363 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.33 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  38.74 
 
 		 355 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  41.45 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  37.88 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 342 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  35.8 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  35.8 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  35.8 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0817  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.533751  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.21 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.87 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  40.18 
 
 		 333 aa  186  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  35.87 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.89 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  37.21 
 
 		 337 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  38.37 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 		 340 aa  182  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  38.42 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  36.91 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 344 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  37.79 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.91 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  36.91 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  36.91 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  36.45 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.06 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  35.91 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  34.26 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.48 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  39.31 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  35.45 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.03 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  35.15 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  35.15 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0351  transcriptional regulator, LacI family  32.74 
 
 		 367 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  39.02 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.65 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.72 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  39.39 
 
 		 344 aa  173  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  39 
 
 		 340 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  35.15 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  34.85 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>